Bariatrik operasyondan sonra Venöz Tromboemboli (VTE) oranı düşük olmakla birlikte tromboembolik komplikasyonlar, bariatrik cerrahi sonrası morbiditenin ana nedenini ve mortalitenin %50'sini oluşturmaktadır. Bu yüzde emboli proflaksisi önem arz eder. Aralıklı pnömatik kompresyon veya kompresyon çorapları gibi mekanik yöntemler ve erken mobilizasyon ile birlikte düşük molekül ağırlıklı heparin kullanımı tramboemboli riskini önemli ölçüde azaltır.