I. Çocuklardaki Yemek Borusu-Mide-Bağırsak Hastalıkları

a- Reflü ile ilişkili durumlar (tekrarlayan kusma, hırıltı, öksürük ve ses kısıklığı) 

b- Yutma güçlüğü (disfaji), alerjik yemek borusu hastalıkları, yemek borusu daralmaları

c- Mide ağrısı, mide yanması ve karında şişkinlik  (gastrit-ülser şüphesi) 

d- Düzelmeyen uzun süreli kabızlık (kronik kabızlık)

e- Düzelmeyen uzun süreli ishaller (kronik ishaller ve malabsorbsiyon sendromları) (Enfeksiyöz enterokolitler, Çölyak-Kistik Fibrozis-Alerjik/Eosinofilik ve Otoimmun Bağırsak Hastalıkları) 

f- Üst ve alt gastrointestinal sistem kanamaları (hematemez, melena ve hematokezya)

g. Kronik kanlı ishal

h. Tekrarlayan ve düzelmeyen karın ağrısı

ı. Akut ve kronik pankreatitler 

i- İnflamatuvar bağırsak hastalıkları (Crohn-Ülseratif Kolit)(düzelmeyen kolit hastalıkları)

J. Ailesel Akdeniz Ateşi

II. Çocuklardaki Karaciğer ve Safra kesesi - Safra Yolu Hastalıkları

1- Yenidoğanın uzamış sarılığı ve kolestaz sendromları (biliyer atrezi, anne sütü sarılığı, safra pigment hastalıkları, enfeksiyöz ve metabolik karaciğer hastalıkları)
2- Nedeni izah edilemeyen karaciğer enzim yüksekliklerinin araştırılması
3- Nedeni bilinmeyen karaciğer-dalak büyümesi
4- Safra kesesinde ve safra yollarında taş (birden fazla veya 1 adet 1 cm’den büyük safra kesesi taşlarının ameliyatı gereklidir) 
5- Viral hepatitler
6- Kronik karaciğer hastalıkları (Wilson hastalığı-otoimmun ve metabolik karaciğer hastalıkları, tanı, tedavi ve izlemi) 
7-Çocuklarda basit karaciğer yağlanması ve steatohepatit tanı ve izlemi
8- Ağır akut karaciğer yetmezliği (ileri hepatik koma tablosu, sıklıkla karaciğer nakli gerekir)
9- Karaciğer Transplantasyonu (Transplantasyona hazırlık ve sonrasında izlem)
10- Portal Hipertansiyon ve hipersplenizm

III. Beslenme Bozuklukları

a- Büyüme geriliği-kilo alamama 
b- Obezite 
c- Yutma güçlüğü, alerjik oral alım sorunları
d- Tekrarlayan kusma