Üst GİS Endoskopi: Genel anestezi eşliğinde uyutulan çocuğun ağzından, ucu kameralı ince ve esnek bir boru ile girilerek, özofagus, mide ve ince bağırsak girişinin (onikiparmak bağırsak) incelenmesidir. Lüzum halinde mukozal biyopsi yapılmaktadır. Bu işlemin riski yüksek değildir. Yapılan iş bir cerrahi müdahale de değildir, sadece görsel bir tanı yöntemidir. Görsel görünüm ve lüzem görülmüşse alınana biyopsi sonucu birlikte değerlendirilerek daha güvenilir tanı konulmasıdır.
İleo-kolonoksopi: Yine genel anestezi eşliğinde uyutularak, makattan ucu kameralı ince ve esnek bir aletle tüm kalın bağırsak ve ince bağırsak son kısmının görsel olarak incelenmesidir. Lüzum halinde mukozal biyopler alınabilir. Polip görülmüşse çıkarılabilir (polipektomi-ameliyatsız kapalı polip tedavisi).
Endoskopi işlemi öncesi aç olmak, kolonoskopi öncesi ise kalın bağırsak temizliği için 3 günlük diet ve bağırsak temizleyici şurupların içilmesi gerekmektedir.
Karaciğer Biyopsisi ve Perkütan Transhepatitk Kolanjiografi (PTK): Hastanemiz Girişimsel Radyoloji Bölümünce, deneyimli uzman veya öğretim üyeleri tarafından, ultrasonografi eşliğinde güvenli bir şekilde yapılmaktadır. İşlem öncesi ve sonrası takip bölümümüzce yapılmakta olup, bir günlük hastanede gözlem sonrası taburcu edilmektedir.